1703.g. Petar Veliki je odobrio gradnju Petropavlovske tvrđave na Zečjem otoku, u cilju obrane šireg prostora od Šveđana. Masivni zidovi i impresivna ulazna vrata karakteriziraju ovu tvrđavu koja zauzima veći dio malenog otoka. U njoj su bili smješteni dio gradskog garnizona i zloglasni zatvor za političke zatvorenike najvišeg ranga. Među prvim zatvorenicima bio je Petrov sin Aleksej, koji je bio mučen i umro u tvrđavi. Blijede ćelije u kojima su bili zatvoreni mnogi poznati Rusi poput Dostojevskog, Gorkog ili Trockog danas su dio muzeja, kao i „Komandantova kuća“ gdje su zatvorenici bili ispitivani.
Pored „Komandantove kuće“ nalazi se katedrala Sv. Petra i Pavla, čiji je visoki i vitki pozlaćeni toranj vidljiv iz svakog dijela grada. Jednostavan i elegantan toranj u suprotnosti je sa bogatom i raznobojnom baroknom unutrašnjošću, od isklesanog mramora ukrašenog zlatom i bljeskajućim kristalima. Tako raskošno ukrašena crkva dostojno je posljednje počivalište ruskih careva dinastije Romanov od Petra Velikog do pretposljednjeg Aleksandra III.